La fisioterapeuta desarrolla y dirige un programa especifico para cada cliente de acuerdo con su lesión, sus necesidades físicas y sus objetivos. Se adapta a cualquier tipo de condición física, edad o lesión. Los objetivos del método de pilates en la rehabilitación del aparato locomotor es mejorar la movilidad articular, rehabilitar la fuerza muscular, restablecer el control neuromuscular, recuperar la integridad funcional, economizar las funciones orgánicas y conseguir la conexión mente-cuerpo.